鴨兒芹屬(Cryptotaenia)在全球有5或6種。中國有鴨兒芹(C. japonica Hasskarl)一種,廣泛分布于中國、日本和朝鮮半島,其葉和花序類型在分布區內展示了幾乎連續的變化,存在以下三種變型鴨兒芹(原變型)C. japonica f. japonica、 深裂鴨兒芹C. japonica f. dissecta (Y. Yabe) Hara和 羽裂鴨兒芹C. japonica f. pinnatisecta S. L. Liou,且與分布于北美的北美鴨兒芹(C. canadensis (Linnaeus) de Candolle)為東亞-北美間斷分布的“姐妹種”。對東亞廣泛分布的鴨兒芹進行了廣泛的取樣并進行標本研究和簡化基因組研究。研究共得到539946個未連鎖的高質量SNP,平均π、HO、HE和FIS值分別為0.062、0.066、0.043和-0.014;種群分化不受距離隔離的影響;確定了與地理位置相對應并表現出不同水平遺傳多樣性的六個主要不同區域;成對FST分析顯示,在連續Bonferroni校正后,六個地區0%-14%的居群存在顯著的群體分化(P<0.05);三次歷史基因流表明了東西方向性。此外,使用Jost’s D、Nei’s GST和Nm值進行的當代基因流分析強調了東亞中緯度地區是鴨兒芹遺傳結構的重要貢獻者。我們的研究闡明了東亞地區鴨兒芹相對較低的遺傳分化和種群結構,進一步加深了我們對中-日植物區系多樣性的理解。
研究成果以“Genetic diversity, population structure, and phylogenetic relationships of a widespread East Asia herb, Cryptotaenia japonica Hassk. (Apiaceae) based on genomic SNP data generated by dd-RAD sequencing”為題發表于國際著名植物學雜志Frontiers in Genetics。植物分類與保護項目組吳寶成副研究員為該論文第一作者和通訊作者。該研究成果得到了國家自然科學基金青年基金項目(31300166)的資助。
論文鏈接:https://doi.org/10.3389/fgene.2024.1368760
圖1 鴨兒芹的生境、植株、果實和不同變型葉片照片
圖2 鴨兒芹居群取樣點分布
圖3 基于Jost’s D 、Nei’s GST 和Nm 的基因流