天胡荽屬(Hydrocotyle)在全球約170余種,全球廣泛分布,中國為該屬三大多樣性分布中心之一。天胡荽屬是研究傘形目進化的關鍵類群。該屬在早期依據部分形態學證據被劃分在傘形科中,近年來通過分子生物學研究被轉入五加科。形態學與分子研究結果的不符導致天胡荽屬的系統位置仍存在爭議。為明晰天胡荽屬在傘形目中的分類地位,厘清屬下物種間的親緣關系,本研究解析了6個天胡荽屬植物的葉綠體基因組結構,并綜合分析了該屬與五加科、傘形科在葉綠體基因組結構上的差異,同時重建了系統發育關系。結果表明天胡荽屬葉綠體基因組在結構上是保守的,在基因構成上偏向于五加科,但存在明顯差異。該研究通過正選擇分析,檢測到天胡荽屬部分葉綠體蛋白編碼基因在傘形目中的獨特演化。該研究的結果為天胡荽屬在傘形目中的分類地位的確定提供了重要證據,并為該屬今后的進一步研究構建了框架。
研究成果以“Plastome structure and phylogenetic relationships of genus Hydrocotyle (apiales): provide insights into the plastome evolution of Hydrocotyle”為題發表于國際著名植物學雜志BMC Plant Biology(中科院2區top,IF=4.3)。植物分類與保護項目組溫珺博士為該論文第一作者,宋春鳳副研究員為通訊作者。該研究成果得到了江蘇省重點實驗室項目(JSPKLB202214)和國家自然科學基金青年基金項目(32200191)的資助。
圖1 傘形科、天胡荽屬和五加科葉綠體基因組大小比較
圖2左:傘形科、天胡荽屬和五加科ycf15基因的核苷酸序列及編碼序列比對分析;右:基于75個CDS推斷的系統發育關系。